Конспект флоры мхов заповедника включает 296 видов среди которых 44 - печоночных и 252 - листостебельных, что составляет более 50 % мохообразных известных с территории Республики Коми (Железнова, Шубина, 1997). В заповеднике под охраной находятся 60 видов мхов, редких для Европейского Северо-Востока России. На выходах коренных скальных пород под пологом леса встречаются редкие не только для республики, но и для Европы виды: миурелла сибирская, неккера перистая, кампилиум Галлера. На мелкоземе вывороченных корней вековых деревьев найдены два вида являющиеся реликтами третичного и ледникового периода - схистостега перистая и буксбаумия безлистная.